Dans un entretien accordé à L'Equipe suite à sa prolongation contrat avec le PSG, Marquinhos n'a pas caché avoir eu des possibilités de départ dans les premières années à Paris :
"Pas maintenant. Au début, j'ai eu une petite phase (sourire), je jouais moins et j'ai eu des propositions. Je pense que tout le monde connaît mon histoire et vous le savez très bien. Mais aujourd'hui, non.
Dans une carrière, un joueur a des hauts et des bas. Mais même dans les moments difficiles, ma première option n'est pas de me cacher, de partir ou d'aller tenter autre chose. Moi, je veux aller au bout de mes objectifs. Si je traverse un moment difficile, je vais travailler pour revenir à mon meilleur niveau."
Le défenseur brésilien fait référence à l'année 2016 où le Barça avait tenté de le recruter. Il a finalement décidé de rester.
Arrivé en 2013 en provenance de la Roma pour 31,4 millions d'euros, il doit faire face à partir de 214 à la concurrence de David Luiz.
Ce n'est qu'à partir de la saison 2016/17 avec l'arrivée d'Unaï Emery que Marquinhos devient pleinement titulaire dans la charnière parisienne au côté de Thiago Silva.
